Si sigues las aventuras de un estudiante de Mystery School llamado Phil, sabrás que fue secuestrado por una nave alienígena. Seguramente intentaste ayudarlo. Sin embargo, todo resultó no ser tan malo. El héroe resultó útil para la tripulación de la nave alienígena y rápidamente se unió al equipo. En el juego Riddle Transfer lo conocerás a él y a sus nuevos amigos. La nave se dirigía hacia la Tierra, pero de repente se perdió el control, alguien controló la nave desde el exterior y la aterrizó por la fuerza en una de las bases secretas. Hombres vestidos de negro y armados se llevaron a todos los pasajeros del barco y colocaron a cada uno en una habitación separada. Ayudarás a Phil en Riddle Transfer y él podrá ayudar a los demás.