La mafia en Japón se llama Yakuza y es una organización criminal muy seria que opera al margen de la ley según sus propias reglas. Si necesita algo, lo toma, sin importar las vidas y necesidades de quienes se interponen en su camino. Samurai vs Yakuza te presenta a un samurái que quiere salvar su aldea. A los bandidos les gustó por el antiguo templo que se encuentra en su territorio. En este templo hay varias estatuillas valiosas que el jefe de la Yakuza quería poseer. Nuestro héroe se interpuso en el camino de todo un ejército mafioso y, con tu ayuda, repelerá el ataque de ladrones vestidos de negro en Samurai vs Yakuza.
